Tungsten in PDB 8prm: The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate

The structure of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate, PDB code: 8prm was solved by L.Vandebroek, A.R.D.Voet, X.Y.Lee, with X-Ray Crystallography technique. A brief refinement statistics is given in the table below:

Resolution Low / High (Å)	39.91 / 2.20
Space group	C 2 2 21
Cell size a, b, c (Å), α, β, γ (°)	63.54, 79.818, 123.439, 90, 90, 90
R / Rfree (%)	19.9 / 26.1

Pages:

>>> Page 1 <<< Page 2, Binding sites: 11 - 20; Page 3, Binding sites: 21 - 30; Page 4, Binding sites: 31 - 40; Page 5, Binding sites: 41 - 48;

Binding sites:

The binding sites of Tungsten atom in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate (pdb code 8prm). This binding sites where shown within 5.0 Angstroms radius around Tungsten atom.
In total 48 binding sites of Tungsten where determined in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate, PDB code: 8prm:
Jump to Tungsten binding site number: 1; 2; 3; 4; 5; 6; 7; 8; 9; 10;

Tungsten binding site 1 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 1 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:41.4 occ:0.50 W1 D:IR0101 0.0 41.4 0.5 O137 D:IR0101 1.7 47.5 0.5 O121 D:IR0101 1.8 42.7 0.5 O81 D:IR0101 1.9 38.1 0.5 O33 D:IR0101 2.0 30.5 0.5 O41 D:IR0101 2.1 33.1 0.5 O1 D:IR0101 2.2 36.7 0.5 P1 D:IR0101 3.4 30.6 0.5 W17 D:IR0101 3.7 39.4 0.5 O65 D:IR0101 3.8 29.9 0.5 W33 D:IR0101 3.8 38.4 0.5 W9 D:IR0101 3.8 47.0 0.5 O17 D:IR0101 3.8 26.8 0.5 O25 D:IR0101 3.9 33.3 0.5 O57 D:IR0101 4.0 34.7 0.5 O9 D:IR0101 4.2 38.1 0.5 O89 D:IR0101 4.5 35.5 0.5 O145 D:IR0101 4.5 48.8 0.5 O129 D:IR0101 4.5 45.0 0.5 O2 D:IR0101 4.6 36.7 0.5 O97 D:IR0101 4.6 30.1 0.5 O153 D:IR0101 4.7 33.1 0.5 O169 D:IR0101 4.7 41.0 0.5 O130 D:IR0101 4.9 44.5 0.5

Tungsten binding site 2 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 2 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:43.9 occ:0.50 W10 D:IR0101 0.0 43.9 0.5 O135 D:IR0101 1.7 48.1 0.5 O150 D:IR0101 1.8 46.6 0.5 O86 D:IR0101 1.9 38.4 0.5 O55 D:IR0101 2.0 38.4 0.5 O62 D:IR0101 2.1 44.5 0.5 O10 D:IR0101 2.2 40.2 0.5 P5 D:IR0101 3.4 38.2 0.5 W26 D:IR0101 3.8 37.8 0.5 W42 D:IR0101 3.8 41.1 0.5 W2 D:IR0101 3.8 41.8 0.5 O78 D:IR0101 3.8 39.9 0.5 O21 D:IR0101 3.9 32.9 0.5 O29 D:IR0101 3.9 39.7 0.5 O46 D:IR0101 4.0 38.7 0.5 ND2 D:ASN22 4.0 44.6 1.0 O2 D:IR0101 4.1 36.7 0.5 NE2 D:HIS46 4.3 46.4 0.0 CE1 D:HIS6 4.4 45.1 0.0 O142 D:IR0101 4.4 47.5 0.5 O96 D:IR0101 4.4 35.3 0.5 O126 D:IR0101 4.5 43.9 0.5 O9 D:IR0101 4.6 38.1 0.5 O102 D:IR0101 4.6 34.2 0.5 O166 D:IR0101 4.7 36.1 0.5 O127 D:IR0101 4.7 41.8 0.5 O182 D:IR0101 4.7 44.4 0.5 NE2 D:HIS6 4.8 44.7 0.5 CE1 D:HIS46 4.8 48.4 0.8

Tungsten binding site 3 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 3 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:41.6 occ:0.50 W11 D:IR0101 0.0 41.6 0.5 O131 D:IR0101 1.7 41.5 0.5 O146 D:IR0101 1.8 37.8 0.5 O82 D:IR0101 1.9 37.7 0.5 O51 D:IR0101 2.0 36.7 0.5 O58 D:IR0101 2.1 30.6 0.5 O12 D:IR0101 2.2 36.8 0.5 P6 D:IR0101 3.4 35.9 0.5 W28 D:IR0101 3.8 34.0 0.5 W43 D:IR0101 3.8 39.5 0.5 O74 D:IR0101 3.8 37.9 0.5 W3 D:IR0101 3.8 39.3 0.5 O23 D:IR0101 3.9 29.0 0.5 O30 D:IR0101 3.9 36.6 0.5 O42 D:IR0101 4.0 29.5 0.5 O3 D:IR0101 4.1 32.6 0.5 O138 D:IR0101 4.4 44.7 0.5 O92 D:IR0101 4.5 36.1 0.5 O122 D:IR0101 4.5 40.7 0.5 O13 D:IR0101 4.6 35.5 0.5 O98 D:IR0101 4.6 35.2 0.5 O162 D:IR0101 4.7 35.8 0.5 O123 D:IR0101 4.7 42.3 0.5 O178 D:IR0101 4.7 31.8 0.5

Tungsten binding site 4 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 4 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:39.8 occ:0.50 W12 D:IR0101 0.0 39.8 0.5 O133 D:IR0101 1.7 39.2 0.5 O149 D:IR0101 1.8 40.0 0.5 O85 D:IR0101 1.9 41.6 0.5 O53 D:IR0101 2.0 33.7 0.5 O61 D:IR0101 2.1 38.0 0.5 O13 D:IR0101 2.2 35.5 0.5 P6 D:IR0101 3.4 35.9 0.5 W29 D:IR0101 3.8 33.5 0.5 W44 D:IR0101 3.8 34.5 0.5 O77 D:IR0101 3.8 38.3 0.5 W4 D:IR0101 3.8 39.0 0.5 O23 D:IR0101 3.9 29.0 0.5 O30 D:IR0101 3.9 36.6 0.5 O45 D:IR0101 4.0 33.3 0.5 O4 D:IR0101 4.2 39.0 0.5 ND2 A:ASN22 4.2 33.8 1.0 CE1 A:HIS46 4.2 32.3 0.9 O141 D:IR0101 4.3 40.4 0.5 NE2 A:HIS46 4.4 33.6 0.8 O94 D:IR0101 4.5 37.3 0.5 O125 D:IR0101 4.5 37.7 0.5 O12 D:IR0101 4.6 36.8 0.5 O101 D:IR0101 4.6 40.6 0.5 O165 D:IR0101 4.7 37.5 0.5 O181 D:IR0101 4.7 39.8 0.5 O128 D:IR0101 4.8 40.9 0.5 CE1 A:HIS6 4.8 39.2 0.6 NE2 A:HIS6 4.9 39.6 0.7

Tungsten binding site 5 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 5 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:52.7 occ:0.50 W13 D:IR0101 0.0 52.7 0.5 O130 D:IR0101 1.7 44.5 0.5 O147 D:IR0101 1.8 47.1 0.5 O83 D:IR0101 1.9 38.5 0.5 O50 D:IR0101 2.0 40.5 0.5 O59 D:IR0101 2.1 34.5 0.5 O11 D:IR0101 2.2 41.6 0.5 P7 D:IR0101 3.4 37.9 0.5 W27 D:IR0101 3.7 42.8 0.5 W45 D:IR0101 3.8 40.7 0.5 O75 D:IR0101 3.8 34.2 0.5 W5 D:IR0101 3.8 39.6 0.5 O22 D:IR0101 3.8 35.8 0.5 O31 D:IR0101 3.9 32.9 0.5 O43 D:IR0101 4.0 32.5 0.5 O5 D:IR0101 4.1 35.1 0.5 O89 D:IR0101 4.5 35.5 0.5 O139 D:IR0101 4.5 46.5 0.5 O123 D:IR0101 4.5 42.3 0.5 O15 D:IR0101 4.6 35.3 0.5 O99 D:IR0101 4.6 31.1 0.5 O163 D:IR0101 4.7 32.6 0.5 O179 D:IR0101 4.7 36.4 0.5 O121 D:IR0101 4.8 42.7 0.5

Tungsten binding site 6 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 6 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:46.8 occ:0.50 W14 D:IR0101 0.0 46.8 0.5 O136 D:IR0101 1.7 42.7 0.5 O152 D:IR0101 1.8 50.9 0.5 O88 D:IR0101 1.9 40.3 0.5 O56 D:IR0101 2.0 38.5 0.5 O64 D:IR0101 2.1 41.3 0.5 O15 D:IR0101 2.2 35.3 0.5 P7 D:IR0101 3.4 37.9 0.5 W31 D:IR0101 3.8 39.2 0.5 W46 D:IR0101 3.8 38.9 0.5 O80 D:IR0101 3.8 33.8 0.5 W6 D:IR0101 3.8 37.4 0.5 O22 D:IR0101 3.9 35.8 0.5 O31 D:IR0101 3.9 32.9 0.5 O48 D:IR0101 4.0 38.4 0.5 NE2 C:HIS46 4.0 44.7 0.3 O6 D:IR0101 4.1 39.5 0.5 O144 D:IR0101 4.4 42.3 0.5 O95 D:IR0101 4.5 32.9 0.5 O128 D:IR0101 4.5 40.9 0.5 CE1 C:HIS46 4.6 43.3 0.7 ND2 C:ASN22 4.6 47.3 0.7 O11 D:IR0101 4.6 41.6 0.5 O104 D:IR0101 4.6 33.7 0.5 CE1 C:HIS6 4.7 47.4 0.2 O168 D:IR0101 4.7 37.8 0.5 O184 D:IR0101 4.7 45.2 0.5 NE2 C:HIS6 4.8 45.4 0.2 O126 D:IR0101 4.9 43.9 0.5

Tungsten binding site 7 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 7 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:44.8 occ:0.50 W15 D:IR0101 0.0 44.8 0.5 O132 D:IR0101 1.7 43.8 0.5 O148 D:IR0101 1.7 37.9 0.5 O84 D:IR0101 1.9 30.9 0.5 O52 D:IR0101 2.0 32.9 0.5 O60 D:IR0101 2.1 29.4 0.5 O14 D:IR0101 2.2 37.3 0.5 P8 D:IR0101 3.4 35.3 0.5 W30 D:IR0101 3.7 38.0 0.5 W47 D:IR0101 3.8 35.9 0.5 O76 D:IR0101 3.8 38.9 0.5 W7 D:IR0101 3.8 41.0 0.5 O24 D:IR0101 3.8 27.1 0.5 O32 D:IR0101 3.9 39.1 0.5 O44 D:IR0101 4.0 27.6 0.5 O7 D:IR0101 4.2 34.5 0.5 O140 D:IR0101 4.4 41.5 0.5 O91 D:IR0101 4.4 32.4 0.5 O124 D:IR0101 4.5 39.5 0.5 O16 D:IR0101 4.6 32.2 0.5 O100 D:IR0101 4.6 33.1 0.5 O164 D:IR0101 4.7 28.1 0.5 O180 D:IR0101 4.7 36.5 0.5 O122 D:IR0101 4.8 40.7 0.5

Tungsten binding site 8 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 8 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:45.0 occ:0.50 W16 D:IR0101 0.0 45.0 0.5 O134 D:IR0101 1.7 46.0 0.5 O151 D:IR0101 1.8 41.3 0.5 O87 D:IR0101 1.9 35.8 0.5 O54 D:IR0101 2.0 29.6 0.5 O63 D:IR0101 2.1 43.0 0.5 O16 D:IR0101 2.2 32.2 0.5 P8 D:IR0101 3.4 35.3 0.5 W32 D:IR0101 3.8 32.2 0.5 W48 D:IR0101 3.8 33.3 0.5 W8 D:IR0101 3.8 38.8 0.5 O79 D:IR0101 3.8 38.8 0.5 O24 D:IR0101 3.9 27.1 0.5 O32 D:IR0101 3.9 39.1 0.5 O47 D:IR0101 4.0 39.3 0.5 NE2 B:HIS46 4.1 38.3 0.1 O8 D:IR0101 4.1 39.6 0.5 ND2 B:ASN22 4.3 37.1 1.0 NE2 B:HIS6 4.4 40.2 0.4 O143 D:IR0101 4.4 42.0 0.5 O93 D:IR0101 4.4 33.0 0.5 O127 D:IR0101 4.5 41.8 0.5 CE1 B:HIS46 4.5 38.1 0.7 O14 D:IR0101 4.6 37.3 0.5 O103 D:IR0101 4.6 36.5 0.5 O167 D:IR0101 4.7 35.9 0.5 CE1 B:HIS6 4.7 41.7 0.5 O183 D:IR0101 4.7 35.1 0.5 O125 D:IR0101 4.9 37.7 0.5

Tungsten binding site 9 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 9 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:39.4 occ:0.50 W17 D:IR0101 0.0 39.4 0.5 O153 D:IR0101 1.7 33.1 0.5 O33 D:IR0101 1.9 30.5 0.5 O65 D:IR0101 1.9 29.9 0.5 O105 D:IR0101 1.9 32.1 0.5 O89 D:IR0101 1.9 35.5 0.5 O17 D:IR0101 2.3 26.8 0.5 W18 D:IR0101 3.3 37.7 0.5 P1 D:IR0101 3.4 30.6 0.5 O41 D:IR0101 3.6 33.1 0.5 W27 D:IR0101 3.7 42.8 0.5 W33 D:IR0101 3.7 38.4 0.5 W1 D:IR0101 3.7 41.4 0.5 O95 D:IR0101 3.7 32.9 0.5 O1 D:IR0101 3.8 36.7 0.5 O70 D:IR0101 3.8 32.6 0.5 O25 D:IR0101 3.8 33.3 0.5 O163 D:IR0101 3.9 32.6 0.5 O111 D:IR0101 4.0 40.3 0.5 O50 D:IR0101 4.4 40.5 0.5 O137 D:IR0101 4.4 47.5 0.5 O121 D:IR0101 4.5 42.7 0.5 O113 D:IR0101 4.5 39.6 0.5 O169 D:IR0101 4.5 41.0 0.5 O22 D:IR0101 4.6 35.8 0.5 O158 D:IR0101 4.6 34.0 0.5 O38 D:IR0101 4.7 34.7 0.5 O2 D:IR0101 4.7 36.7 0.5 W31 D:IR0101 5.0 39.2 0.5

Tungsten binding site 10 out of 48 in the The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Tungsten with other atoms in the W binding site number 10 of The Structure of NVBAGEL2 Binding the P8W48O184 Polyoxometalate within 5.0Å range: probe atom residue distance (Å) B Occ D:W101 b:37.7 occ:0.50 W18 D:IR0101 0.0 37.7 0.5 O158 D:IR0101 1.7 34.0 0.5 O38 D:IR0101 1.9 34.7 0.5 O70 D:IR0101 1.9 32.6 0.5 O105 D:IR0101 1.9 32.1 0.5 O95 D:IR0101 2.0 32.9 0.5 O17 D:IR0101 2.3 26.8 0.5 W17 D:IR0101 3.3 39.4 0.5 P1 D:IR0101 3.4 30.6 0.5 O46 D:IR0101 3.6 38.7 0.5 O89 D:IR0101 3.7 35.5 0.5 W31 D:IR0101 3.7 39.2 0.5 W34 D:IR0101 3.7 39.8 0.5 W2 D:IR0101 3.7 41.8 0.5 O2 D:IR0101 3.8 36.7 0.5 O65 D:IR0101 3.8 29.9 0.5 O25 D:IR0101 3.8 33.3 0.5 O168 D:IR0101 3.9 37.8 0.5 ND2 D:ASN62 3.9 40.4 1.0 O111 D:IR0101 4.0 40.3 0.5 O56 D:IR0101 4.4 38.5 0.5 O142 D:IR0101 4.4 47.5 0.5 O113 D:IR0101 4.5 39.6 0.5 O126 D:IR0101 4.5 43.9 0.5 O174 D:IR0101 4.5 37.3 0.5 O22 D:IR0101 4.6 35.8 0.5 O153 D:IR0101 4.6 33.1 0.5 O33 D:IR0101 4.7 30.5 0.5 O1 D:IR0101 4.7 36.7 0.5

L.Vandebroek, A.R.D.Voet, X.Y.Lee. The Structure of V13BAGEL2 To Be Published.